Ca 2＋信号的终止需要降低胞内Ca 2＋浓度，但这种降低仅靠胞质的缓冲能力还远远不够。为了避免胞内过高Ca 2十浓度对细胞产生损害，细胞通过各种通道将Ca 2＋排出胞外或重摄入Ca 2＋库。

质膜Ca2＋转运

质膜的Ca 2＋转运主要依靠Ca 2＋泵和Na+／Ca2+交换器。前者需要ATP提供能量，而后者则要依靠胞内外的Na+浓度梯度。Ca2+泵与Ca2+的亲和力很高，每分解一个ATP可将1-2个Ca 2+运出胞外，同时将H+转移至胞内。Ca 2＋泵的转运过程需要Mg 2＋的存在。Ca 2＋泵受几个因素调节：CaM和PIP2的激活，C端的水解，PKA和PKC的活化。

Na+/Ca 2+交换器主要存在于兴奋性细胞上，如神经细胞和肌细胞。一个Ca 2＋运出的同时，3个Na＋移至胞内。

Ca2＋库的重摄入

内质网和肌质网上也有类似的Ca 2＋泵，靠水解ATP将Ca2+摄入Ca2＋库，其调节迅速而灵敏。此外，质膜上还存在一种可让Ca2十持续、缓慢补充Ca 2＋库的离子通道，即Ca2＋库操纵Ca 2＋通道（store-operatedchannels, SOC )。其调节机制目前尚不清楚。