北京普天同创生物科技有限公司
RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用,从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。RT -PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平、细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA, mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组DNA的污染。用于反转录的引物可视实验的具体情况选择随机引物、Oligo dT及基因特异性引物中的一种。对于短的不具有发夹结构的真核细胞mRNA, 3种都可。
核酸研究已有100多年的历史,上世纪60年代末、70年代初,人们开始致力于研究基因的体外分离技术。Korana于1971年最早提出核酸体外扩增的设想:“经过DNA变性,与合适的引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可克隆tRNA基因”。1985年,美国PE-Cetus公司人类遗传研究室的Mullis等发明了具有划时代意义的聚合酶链式反应。其原理类似于DNA的体内复制,只是在试管中给DNA的体外合成提供一种合适的环境条件,即模板DNA、寡核苷酸引物、DNA聚合酶、合适的缓冲体系、DNA变性、复性及延伸的温度与时间。
Mullis最初使用的DNA聚合酶是大肠埃希菌DNA聚合酶I的Kle-now片段,其缺点是:
① Klenow酶不耐高温,90℃会变性失活,每次循环都要重新加入新的聚合酶;
②引物链延伸反应在37℃下进行,容易发生模板和引物之间的碱基错配,其PCR产物特异性较差,合成的DNA片段不均一。此种以Klenow酶催化的PCR技术虽较传统的基因扩增具备许多突出的优点,但由于Klenow酶不耐热,在DNA模板进行热变性时,会导致此酶钝化,每加人一次酶只能完成一个扩增反应周期,给PCR技术操作程序添了不少困难。这使得PCR技术在一段时间内没能引起生物医学界的足够重视。
1988年初,Keohanog改用T4 DNA聚合酶进行PCR,其扩增的DNA片段很均一,真实性也较高,只有所期望的一种DNA片段。但每循环一次,仍需加入新酶。1988年Saiki等从温泉中分离的一株水生嗜热杆菌(thermus aquaticus)中提取到一种耐热DNA聚合酶。此酶具有以下特点:
①耐高温,在70℃下反应2h后其残留活性大于原来的90%,在93℃下反应2h后其残留活性是原来的60%在95℃下反应2h后其残留活性是原来的40%;
②在热变性时不会被钝化,不必在每次扩增反应后再加新酶;
③大大提高了扩增片段特异性和扩增效率,增加了扩增长度(2. 0Kb )。由于提高了扩增的特异性和效率,其灵敏性也大大提高。为与大肠埃希菌多聚酶I Klen、片段区别,将此酶命名为Taq DNA多聚酶(Taq DNA Polymerase )。此酶的发现使PCR技术得到了广泛的应用。
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