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构建U6启动子启动的siRNA表达载体的方法

发布时间:2015-09-18 00:00 作者:中国标准物质网 阅读量:2244

体内表达siRNAs是近来广泛采用的方法。目前体内表达的方法主要是载体表达(质粒载体、腺病毒载体)与siRNA表达框表达。这两种方法的核心原理都是将siRNAs对应的DNA模板插入载体或表达框中,位于RNA聚合酶IQ启动子的下游,在RNA聚合酶的作用下转录产生含发夹结构,并以一串U结尾的siRNA,利用该siRNA抑制基因的表达。现以构建U6启动子启动的 siRNA表达载体为例进行说明。另外阳离子脂质体在真核细胞转染中的应用非常广泛,且该方法比较简单。因此,本试验也将应用这种方法将重组质粒转染进目的细胞内。

材料

与mRNA靶序列一致和互补的寡核苷酸序列;piGENETM hU6质粒;MinElute凝胶提取试剂盒(Qiagen) ; MinElute PCR纯化试剂盒(Qiagen);高效连接试剂盒(Takara );细菌碱性磷酸酶(BAP)或牛小肠碱性磷酸酶(CIAP);BspM I限制性内切酶及反应缓冲液(TOYOBO);LIPOFECTAMINE 2000(INVOTROGENE)。

操作步骤

(1) 体内表达siRNA所需双链寡核昔酸的合成确定靶序列之后,根据要求合成两条单链寡核苷酸。

(2)单链寡核苷酸融合生成双链合成所需各条单链寡核苷酸后(20D),将每组序列相应的两条单链融合生成双链寡核昔酸。

1) 用100-150mmol/L NaCl溶液分别溶解两条单链寡核苷酸至100μmol/L。

2)取0. 5ml小离心管,加入两条单链寡核苷酸溶液各2.5μl,混匀,离心。

3)将该混合物99℃水浴2 min,迅速降温至72℃,从72℃梯度降温至4℃。瞬时离心5秒,轻轻混匀。将退火的寡核苷酸1 : 200稀释,取1μl以备连接,其余-20℃保存备用。

(3)制备质粒表达载体

1) BspM I消化3-5μg piGENETM hU6质粒,37℃酶切过夜。载体piGENETmhU6在U6启动子下游有两个BspM I酶切位点,BspM I是一种限制性内切酶,利用这一特性可以将siRNA编码的序列插到U6启动子后面。

2) 1%琼脂糖凝胶分离酶切后的载体,用凝胶提取试剂盒提取回收DNA。

3)用BAP/CIAP将回收的载体DNA去磷酸化。BAP去磷酸反应混合物(100 μ1)包含BspM I消化的载体DNA (3 μg ),1×BAP缓冲液,BAP酶(3-5U)、65℃孵育1h。

4)应用MinElutePCR纯化试剂盒纯化DNA,最后溶解于30μl去离子水中,取1 μl以备连接。

(4)双链寡核苷酸克隆人质粒载体混合1μl质粒、1μl插入DNA和2μ1 ligation buffer, 16℃孵育30min。

(5)连接反应物转化大肠埃希菌宿主细胞(如DH5 a ),并在含氨节青霉素的LB培养板上挑选菌株。

(6)用质粒小量制备法,从细菌克隆中提取重组质粒。

(7)应用PCR扩增以及测序的方法对重组质粒进行鉴定。

(8) 将测序鉴定正确的质粒,应用LIPOFECTAMINE 2000转染到目的细胞内,具体操作步骤如下:

1) 转染前一天,胰酶消化细胞并计数,细胞铺板,使其在转染次日密度为90%。细胞铺板在0. 5 ml含血清,不含抗生素的正常生长的培养基中。

2)对于每孔细胞,使用50μl无血清培养基稀释0.8-1. 0μgDNA,5min。

3)对于每孔细胞,使用50μ1无血清培养基稀释1-3 μ1 LIPO-FECTAMINE 2000试剂,5 min。

4) 混合稀释的DNA和稀释的LIPOFECTAMINE 2000,在室温20min。

5) 移去细胞培养板内的含血清的正常生长培养基,替换为0. 5m1无血清培养基。

6) 直接将混合物放入每孔中,摇动培养板,轻轻混匀。

7)在37℃、5%CO2的培养箱中培养,4-5h后将无血清培养基更换为含血清培养基。

8) 在细胞中加入复合物24-72h后,分析细胞抽提物。

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