存活率的分析可以用于检测细胞的损伤情况，如原代分离、细胞分离或复苏后活细胞的比例。对存活率的检测多数都是基于细胞死亡后膜的完整性发生了破坏这一原理，染料的摄取能力可以反映细胞的存活率。某些染料在正常情况下不能进入细胞内，如台盼蓝、藻红或萘黑，或是正常时可以被活细胞摄取并储留其间，细胞死亡后则被释放出来，如二乙酰荧光素或中性红，这时就可以通过染料的分布位置来判断细胞的生存状况。然而，这种检测只能说明当时的状况，并不能反映细胞后续的生存能力。而且，染料排斥法经常过高地估计了细胞的生存率，例如保存在液氮中的细胞在复苏后有90％的细胞都排斥台盼蓝，看上去似乎都是活细胞，但事实上在24小时后仅有60％的细胞能够贴壁。