可以去除支原体。有些细胞已成功去除，并仍在使用。但是，这个过程费时、费力，还不一定成功。弃掉支原体污染的细胞，重新开始培养是更好的选择。

支原体去除应在敏感性检测的基础上选择敏感抗生素，用于去除支原体。用含抗生素的培养液培养污染细胞1-2周，再用无抗生素的培养液培养1-2个月，再用较敏感的PCR法重复检测支原体，确保培养细胞没有污染。使用过程中还应定期重复检测，防止再被支原体污染。支原体去除过程，有可能筛出的细胞群体发生漂移，所以经支原体去除的细胞应重新检测其特性，确保该细胞仍保留原细胞系的性质。