鞭毛是细菌的运动器官，它是生长在细菌细胞表面一条或多条的细长、波曲、毛发状的线状体结构。鞭毛是由细胞质膜上的鞭毛基粒生长出，其长度往往超过菌体的若干倍，最长可达70μm，一般10-20nm，直径很细，鞭毛的运动引起细菌的运动。鞭毛的着生部位、数目和排列方式是种的鉴定特征，为分类鉴定的依据之一。有单根鞭毛（一端或两端着生）、束生鞭毛（一端或两端着生）及周生鞭毛，见图1.5。一般杆菌和螺旋菌多可以生长鞭毛，球菌的鞭毛少，仅有芽孢八叠球菌属生长鞭毛。鞭毛的微细结构可以通过特殊染色的方法后，在电子显微镜下进行观察。