20世纪80年代，生物完整性指数这一概念由美国生物学家Karr首先提出并使用，是河流湖泊生态健康评价的重要指标之一。生物完整性的含义是支持和维护一个与地区性自然生境相对应的生物集合群的物种组成、多样性和功能等方面的一种稳定能力，是生物为了适应外界环境而长期进化的结果。简言之，生物完整性指数，即可定量描述人类干扰与生物特性之间的关系，且对干扰反应敏感的一组生物指数。应用于水生生态系统的完整性指数主要包括：鱼类群落生物完整性指数（Fish Index of Biotic Integrity, F-IBI)、浮游生物完整性指数（Planktonic Index of Biotic Integrity, P-IBI)、底栖动物完整性指数（Benthic index of Biotic Integrity, B-IBI）和高等维管束植物完整性指数（Vegetation Index of Biotic Integrity, V-IBI)等。以鱼类群落为研究对象的F-IBI是最早建立的，而后逐渐应用到底栖动物、浮游生物和大型维管束植物。

（1)底栖动物完整性指数（表9.4)

(2）鱼类群落生物完整性指数（表9.5)

(3) F-IBI生物完整性等级划分及特征（表9.6)

美国是最早也是应用地区最广的国家。现在美国环保局己将水质生物评价的重点转向水生态系统健康评价，其核心就是生物完整性指数，而其中应用最多的是底栖动物完整性指数，其次为鱼类群落生物完整性指数。我国起步较晚，直到21世纪初才有一些实际应用，利用生物完整性指数评价河流湖泊的生态健康是一种趋势，在我国应该得到更广泛更深入的应用。