高效液相色谱法经过30年的发展，在色谱理论研究、仪器研制水平、分析实践应用等方面，已取得长足的进步。
高效液相色谱法适于分析沸点高、相对分子质量大、热稳定性差的物质和生物活性物质，它们约占全部有机化合物的80％。现在高效液相色谱法已在生物化学和生物工程研究、制药工业研究和生产、食品工业分析、环境监测、石油化工产品分析中获得广泛的应用。

1.在生物化学和生物工程中的应用

当前，随着生命科学和生物工程技术的迅速发展，人们对氨基酸、多肽、蛋白质及核碱、核苷、核苷酸、核酸（分为核糖核酸RNA、脱氧核糖核酸DNA）等生物分子的研究兴趣日益增加。这些生物活性分子是人类生命延续过程中必须摄取的成分，也是生物化学、生化制药、生物工程中进行蛋白质纯化、DNA重组与修复、RNA转录等技术中的重要研究对象，因此涉及它们的分离、分析问题也日益重要。

高效液相色谱法中的反相色谱法、凝胶色谱法和离子色谱法等都可用于上述多种生物分子的分离和分析。

2.在医药研究中的应用

高效液相色谱法由于具有高选择性、高灵敏度等特点，已成为医药研究的有力工具。

人工合成药物的纯化及成分的定性、定量测定，中草药有效成分的分离、制备及纯度测定，临床医药研究中人体血液和体液中药物浓度、药物代谢物的测定，新型高效手性药物中手性对映体含量的测定等，都需用高效液相色谱的不同测定方法予以解决。

3.在食品分析中的应用

食品是人类生活中不可缺少的必需品，是人类生命活动能源的来源。食品种类繁多，各种食品具有不同的特性和营养成分，它所包含的糖、有机酸、维生素、蛋白质、氨基酸、脂肪等直接关系到人体的健康。在食品生产过程中，往往须添加防腐剂、抗氧化剂、人工合成色素、甜味剂、保鲜剂等化学物质，它们的含量过高就会危害人体健康。此外环境污染，也会使食品玷污有害的微量元素、农药残留、黄曲霉素等二因此食品分析日益受到人们的关注。

近年来高效液相色谱分析法在食品分析中的应用日益增多，它比化学分析法操作简便、快速，并能提供更多的有用信息。

4.在环境污染分析中的应用

高效液相色谱方法适用于对环境中存在的高沸点有机污染物的分析，如大气、水、土壤等中存在的多环芳烃、多氯联苯、有机氯农药、有机磷农药、氨基甲酸酯农药、含氮除草剂、苯氧基酸除草剂、酚类、胺类、黄曲霉素、亚硝胺等。

5.在精细化工分析中的应用

在精细化工生产中使用的具有较高相对分子质量和较高沸点的有机化合物，如高碳数脂肪族或芳香族的醇、醛和酮、醚、酸、酯等化工原料，以及各种表面活性剂、药物、农药、染料、炸药等工业产品，都可使用高效液相色谱法进行分析。