毛细管电泳(capillary electrophoresis，CE)，又称高效毛细管电泳(high perform—ance capillary elctrophoresis，HPCE)，是在毛细管中进行电泳分离和分析的方法。但它实际上并不是一种单纯的电泳过程，而是以电场为驱动力，以毛细管为分离室、依据样品的浓度和分配行为来分离分析物质的一类新型液相技术。

作为一种新型高效快速的分离分析技术，CE的应用以极其迅猛的速度在各领域中展开。虽然还有许多技术问题有待进一步完善，但其独特的优越性已经使其得到较广泛应用。

结合CE的特殊性质，对有关理论进一步讨论。电泳和色谱的分离过程都是差速迁移过程，可以用相同的理论来描述，如色谱中所用的一些名词概念和基本理论，如保留值、塔板理论和速率理论等均可借用于CE中。

单位电场强度下的电泳速度称为淌度或电迁移率，在无限稀释溶液测得的淌度称为绝对淌度。在实际溶液中，离子间互相影响，离子的形状、大小及所带电荷都可能与绝对淌度环境下的不同，把物质在实际溶液中的淌度称为有效淌度。物质粒子在电场中的迁移速度决定于粒子淌度和电场强度的乘积，所以淌度不同是电泳分离的内因。

在CE中，离子在电场中的迁移速度不仅取决于离子的有效淌度和电场强度，而且还与电渗流速度有关，相应的淌度为表观淌度。不同物质在电泳中的表观淌度不同，即它们的表观迁移速度不同,因而得以分离。

离子所带电荷越多，解离度越大，体积越小，溶液的黏度越小，电泳速度就越快，这是电泳分离及其条件选择的根本依据，而电场强度和电渗流速度也影响电泳的分离。