平板电泳法已收载于多国药典中，作为某些药物的鉴别、纯度检测、含量测定和分子量测定的法定方法。

虽然作为药品检验的常规方法，CE在药品标准中的应用实例还不多，但在药物分析中的应用研究已经非常广泛，可分为化学分析、中药成分分析、手性对映体分析、体内分析等。被分析的物质有离子、小分子药物、基因工程产品、蛋白、手性对映体等。样品来源为各种药物及其制剂、天然产物、复方制剂及各种生物样品等。

1．含量分析

作为HPLC的变通和互补方法，CE已广泛用于药物的定量分析。

2．杂质分析

应用CE法对杂质定量，与液相色谱法相似。

3．手性对映体

CE应用于对映体分离时，一般可以直接在缓冲液或流动池中加入手性添加剂。环糊精就是一种常用的手性添加剂，此外，常用的添加剂还有冠醚、胆盐、表面活性剂、多肽等。由于具有无需手性分离柱，手性添加剂用量少，适用范同广等特点，CE已成为实现手性分离的一种重要手段。

加兰他敏对映异构体的测定

加兰他敏(Galantamine)是从石蒜属植物中分离的一种生物碱，加兰他敏的S型对映异构体是药效成分，通过测定R型对映体含量来监控药物质量十分必要。该药物的测定方法有非水滴定法、紫外分光光度法和高效液相色谱法，它们均不能分离和测定对映异构体。用cE法可分离分析加兰他敏对映异构体，以控制药物质量。

测定法背景电解质为pH=3的30mmoL／L的Na₂HPO₄缓冲液体系，内含40mmol／L的a-环糊精。压力进样(1s缓冲液，2s样品)，分离电压为12kV，于214nm处进行紫外检测，柱温恒定在25℃。

该原料药含有10个组分，测定R型单体电泳峰面积与浓度关系的工作曲线，线性范围0.015～1．0mmol／L，相关系数r₂=0.9992，相对于活性成分的最低定量限为0.12％，最低检测限为0.04％(s／N=3)。根据峰面积计算出原料药物中R型单体浓度为0.82％(n=5)，R与s的含量比1.0％(n=5)，5次重复测定的迁移时间和峰面积的标准偏差分别为0.20％和2.6％，可成为快速有效的控制药物质量方法。