凝胶渗透色谱法又称尺寸排阻色谱法或分子筛色谱或凝胶过滤色谱法。它采用具有网状结构、多孔性的固定相，利用试样的组分分子对固定相网状结构内部渗透性的差异来分离各组分。渗透深的组分因不易洗脱而保留时间较长，渗透浅的则易洗脱而保留时间短。实际上它是按分子大小顺序进行分离的一种色谱方法，分子大的不易渗透而被排阻，小分子则易渗透，不被排阻，最后分离流出的顺序与排阻分子的大小有关。

凝胶色谱法适用于分子量大于2000的非离子型的高分子化合物的分离。南于流出的顺序与分子量大小有关，因此凝胶色谱还可用于聚合物的分子量分布测定以及平均分子量的测定。

凝胶色谱法的色谱峰窄，能迅速流出，易检测。它是一种最稳定的分离方法，不存在其他的保留机制，因而不会发生试样的化学变化和损耗，离子也不易失活。其缺点是对于分子大小相近的组分以及复杂多组分的分离不够满意。

凝胶色谱的常用同定相有多孔型的半刚性凝胶和刚性凝胶两大类。凝胶是一类具有交联结构，能含大量液体(一般为水)的弹性物质(多聚体)。为了使凝胶湿润、溶胀，流动相常采用低黏度的溶剂。选择的溶剂还需能溶解试样，能与检测器相匹配。常用的流动相有四氢呋喃、甲苯、邻二氯苯、二氯乙烷、三氯甲烷、苯、四氯化碳和水等。与其他色谱方法不同的是，凝胶色谱的流动相不需要用改变组成的办法来调节分离。

根据其特点，凝胶色谱主要应用在生物化学和高分子化学领域。在药物分析中，已广泛地应用于测定药物聚合物的分子量分布，如多糖、高分子抗生素药物等，对于单个大分子，如蛋白质、核酸等也同样可获得很好的分离，其应用将会得到进一步扩展。