与大多数湿法高压装填的HPLC柱不同，SPE柱采用的是干法常压装填。因此，其吸附剂的密度要比HPLC小很多。这也是SPE柱效低的原因之一。对于指定的吸附剂，其颗粒内部的平均间隙是不变的。但是，受到装填技术的影响，吸附剂装填的密度会有所不同。不同的装填密度导致SPE柱的总间隙，很明显，吸附剂装填的密度会影响SPE柱的动力学性质。为了保证SPE柱的重现性，在SPE柱的生产过程中必须保持柱与柱之间，批号与批号之间吸附剂装填的密度尽可能一致。

在固相萃取中，控制样品通过SPE柱的流速和从SPE柱上洗脱目标化合物的流速是两个十分重要的因素，因为SPE柱的塔板数受流速的影响。两根C18SPE柱的塔板数分别为50和20。装填的吸附剂都约为360 mg，柱床体积都约为0.5 mL。很明显，塔板数随流速的增加而减少，而且塔板数越高，受流速的影响越大。由此可见，控制流速在固相萃取中是十分重要的。手工固相萃取中常用的真空萃取装置难以对流速进行准确的控制。而采用正压技术的自动化固相萃取系统则可以对液体经过SPE柱的流速进行控制。这也是自动化固相萃取系统能够改善固相萃取可靠性的一个原因。

由于穿透体积与塔板数有关，流速影响了塔板数，当然也影响了穿透体积。很显然，穿透体积随样品通过柱床的流速增加而迅速降低。换句话而言，要得到大的穿透体积，就要降低样品通过柱床的流速。

在保持固相萃取装置高度不变的前提下，要提高样品通过SPE装置的流速，最简便的方法就是扩大其直径，因为流速正比于直径的平方。这也是推出固相萃取膜的原因之一。