为了得到化合物更多的结构信息，需要进行多级质谱分析。此外，APIMS可选用不同类型的质谱仪以满足工作的需要。本入门将讨论与API离子源连接的各种质量分析器的性能特点。

第一 电喷雾和高电压的连接。

无论是电喷雾或是气动辅助电喷雾，喷雾针均处于高电场下。就原理而言，电场的产生可将高压电源连接至喷雾针而将离子源接地，或者相反，将喷雾针接地而将离子源接至高压，还可将喷雾针和离子源分别接至不同的电源。选择何种接法，取决于所用的质谱仪和液相分离联用系统，以将离子从离子源的大气压腔转移至质量分析器的真空中。四级杆质谱仪，喷雾针可谓+ - 5 kV，而反电极（取样孔）处于地电压；在扇形磁场质谱仪中，当用ESI源时，加速电压常限于3-5kV，故喷雾针电压对地位8-10 kV。

为了保护操作者，离子源的设计应适当绝缘或有安全内锁。如喷雾针为高压，与HPLC或注射器泵链接应采用熔融二氧化硅毛细管。应当注意，如毛细管中充满电解质溶液，熔融二氧化硅毛细管不再是绝缘体，而是一个电阻。此时，如操作者接触喷雾针或注射泵的针和活塞，可因点击而刺痛。为安全起见，当ESI工作时（加上了高压），操作者不应该拆装链接管线。更好的方法是将注射器泵接地。

值得注意的是，喷雾针链接高压是否会影响样品经熔融二氧化硅毛细管的传输，以及在和毛细管电泳联用时是否干扰毛细管电泳系统的工作。毛细管电泳独立工作是，通常在养鸡和阴极间加以30 kV的电压。

在CE/MS正离子操作时，阴极处于喷雾针的电压，如5kV。这样加在毛细管柱上的电压降低至25kV，导致分析时间的延长。在简单的CE/MS系统中，从CE电源流出的电流只有很少的部分为带电雾滴所带走，大部分电流流入ESI源。ESI电源是设计为供电电源的，而不是接受电流的。如ESI电源接受的电流太多，电源内部反馈电路将不能保持电源输出电压的稳定，导致输出电压失控升高和电喷雾的不稳定。