动物组织中药物残留水平通常都较低，除极少数能发生急性中毒外，绝大多数药物残留通常产生慢性、蓄积毒性作用。长期食用兽药残留超标的食品后，当体内蓄积的药物浓度达到一定量时会对人体产生多种急、慢性中毒。

近些年来，世界范围内兽药残留事件不断出现，如二嗯英污染禽肉事件，人食用二嗯英后可引起人体软组织、结缔组织、肺和肝肿瘤，降低男性精子数和性功能，降低女性受孕率，导致婴儿出生缺陷如腭裂等，甚至对后代产生有害影响。国内外有多起有关人食用“瘦肉精”(盐酸克仑特罗)超标的猪肺脏而发生急性中毒事件的报道。我国浙江、广东、四川等地发生的“瘦肉精”残留中毒事件，导致食用者头痛、手脚颤抖、狂躁不安、心动过速和血压下降等，严重者危及生命。此外，人体对氯霉素反应比动物更敏感，特别是婴幼儿的药物代谢功能尚不完善，氯霉素的超标可引起致命的“灰婴综合征”反应，严重时还会造成人的再生障碍性贫血。

四环素类药物能够与骨骼中的钙结合，抑制骨骼和牙齿的发育凹]。红霉素等大环内酯类可致急性肝毒性。大部分的氟喹诺酮类药物具有光敏作用，个别品种在真核细胞内已经显示致突变作用。一些碱性和脂溶性药物的分布容积较高，在体内易发生蓄积和慢性中毒，如大环内酯类药物红霉素、泰乐菌素等易引起肝损害和听觉障碍。氨基糖苷类药物，如链霉素、庆大霉素和卡那霉素主要损害前庭和耳蜗神经，导致听力减退。链霉素具有潜在的致畸作用。

磺胺类药物在临床的使用已有70年的历史，虽然20世纪40年代以后，各类抗生素的不断发现和发展，在临床上逐渐取代了磺胺类。但磺胺类具有抗菌谱广，又可抑制球虫，价格低廉等优点，目前仍是最常用的兽药之一，但组织残留和饲料污染问题比较严重。