随着质谱技术的不断改进和完善，质谱的应用范围已扩展到生命科学研究的许多领域，特别是质谱在蛋白质、医学检测及核酸等领域的应用。电喷雾质谱技术和基质辅助激光解吸附质谱技术具有高灵敏度和高质量检测范围，使得在pmol/L甚至fmol/L的水平上准确地分析分子量高达几万到几十万的生物大分子成为可能，从而使质谱技术真正走入了生命科学的研究领域，并得到迅速的发展。以下主要介绍与生物医学有关的几项质谱技术。

电喷雾质谱技术（electrospray ionizsation mass spectrometry, ESI-MS)是在毛细管的出口处施加一高电压，所产生的强电场使从毛细管流出的液体雾化成细小的带电液滴，随着溶剂蒸发，液滴表面的电荷强度逐渐增大，最后液滴崩解为大量带一个或多个电荷的离子，使分析物以单电荷或多电荷离子的形式进入气相。

基质辅助激光解吸附质谱技术（matrix一assisted laser desorption/i-onization, MALDI）是将分析物分散在基质分子中并形成晶体，当用激光照射晶体时，由于基质分子经辐射所吸收的能量，导致能量蓄积并迅速产热，从而使基质晶体升华，基质和分析物膨胀并进入气相。MAL-DAI所产生的质谱图多为单电荷离子，因而质谱图中的离子与多肽和蛋白质的质量有一定的对应关系。MALDI产生的离子常用飞行时间(Time-of-Flight, TOF)检测器来检测。理论上讲，只要飞行管的长度足够，TOF检测器可检测分子的质量数是没有上限的。因此，MALDI-TOF质谱很适合对蛋白质、多肤、核酸和多糖等生物大分子的研究。

快原子轰击质谱技术（fast atom bombardment mass spectrometry,FABMS）是一种软电离技术，是用快速惰性原子射击存在于底物中的样品，使样品离子溅出进入分析器，这种软电离技术适于极性强、热不稳定的化合物的分析，特别适用于多肤和蛋白质等的分析研究。