离子源的作用是将被分析的样品分子电离成带电的离子，并将离子会聚成有一定几何形状和一定能量的离子束，然后进入质量分析器被分离。为了研究被测样品分子的组成和结构，就应使该样品的分子在被电离前不分解，这样电离时可以得到该样品的分子离子峰。为了使稳定性不同的样品分子在电离时都能得到分子离子的信息，就需采用不同的电离方法。在天然产物分析特别是挥发油的GC/MS分析中使用最广泛的离子源是电子轰击离子源（EI)。