微型生物群落(microbial community)是指水生态系统中显微镜下才能看见的微小生物，主要是细菌、真菌、藻类、原生动物和微型原生动物等。它们占据着各自的生态位，彼此间有复杂的相互作用，对其生存环境的变化十分敏感，当水体受到污染后，群落的结构和功能将随之发生相应的改变。
        美国的Cairns等于1969年创建了用聚氨酯泡沫塑料块(polyurethane foam unit，简称PFU)法测定微型生物群落的群集速度。该法是将PFU作为人工基质投入水体中，暴露一定时间(静水中约需4周，流水中约需2周)后，水体中大部分微型生物种类可群集到PFU内。取出PFU后，把水全部挤于烧杯内，用显微镜进行微型生物种类观察和活体计数，以评价水质。该法的特点是基质的使用不受时问和空问的限制，能收集到水体中微型生物群落中85％的种类，因此具有环境的真实性。1991年我国颁布了国家标准“水质微型生物群落监测 PFU法”(GB／T 12990一91)。
        根据MacArthur—wilson的岛屿地理学理论，原生动物在PFU内的群集过程，是原生动物的迁入和迁出的动态平衡结果，因此该过程可以用岛屿区域地理平衡模型修正式表示：
      S_eq(1-e^-Gt)
S_t=─────────
       1+He^-Gt
         式中：G——群集速度常数；
               t——群集时间；
               H——污染强度级；
         S_t，S_eq——分别为t时刻原生动物的种类数和平衡时原生动物种类数。
        因此，PFU法除了提供结构参数(种类组成、多样性指数)外，还能提供群落的三个功能参数，即S_eq、G和达到90％平衡期种类数所需要的时间T_90%。在受到污染的水体中，原生动物向PFU群集的速度受到干扰，使S_eq和G值较清洁水体中低，群集时间T_90%变长。在生物组建水平中，群落水平高于种和种群水平，因而在群落水平上的生物监测和毒性试验比种和种群水平更具有环境真实性。

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