一.细胞膜

细胞膜（cell membrane）或称胞质膜（cytoplasmic membrane)，位于细胞壁内侧，紧包着细胞质，为柔软而具有一定弹性的半渗透膜。厚5～10 nm，主要由磷脂和蛋白质组成，柔韧致密，富有弹性，占细胞干重的10％～30％。细菌细胞膜的结构与真核细胞基本相同，化学组成主要有磷脂、蛋白质和少量的多糖，与真核生物细胞膜不同的是不含胆固醇类物质。
细胞膜的主要功能如下：①选泽性控制细胞内、外营养物质及代谢产物的运输，不允许大多数亲水性分子通过，某些脂溶性分子、CO₂和O₂肩能选择性通过；②细胞膜上有多种呼吸酶，参与细胞的产能代谢；③部分细胞膜内陷、折叠形成中介体（mesosome)，中介体扩大了细胞膜的表面积，除参与细胞分裂外，其作用类似真核细胞的线粒体；④合成细菌细胞壁及胞外附属结构的场所；⑤作为鞭毛的着生点，为鞭毛的运动提供能量。

二.细胞质

细胞膜包裹的无色半透明的胶状物质为细胞质（cytoplasm)，或称原生质(protoplasm)，其化学组成中80％为水，还有蛋白质、脂类、核酸及少量糖和无机盐。细胞质是细菌的内在环境，是细菌合成蛋白质、核酸的场所。细胞质中尚有许多重要结构，如质粒、核糖体、胞质颗粒等。

1．质粒(plasmid)质粒是细菌染色体外的遗传物质，为闭合环状的双链DNA分子，其相对分子质量远小于染色体，所携带的基因数也很少，通常只有1～200个，可控制细菌某些特定的遗传性状，如性菌毛、细菌素、毒素和耐药因子等。质粒具有独立复制、传给子代及在细胞之间转移等特性，但是质粒不是细菌生长必不可少的，能自行丢失或经人工处理而消失，失去质粒的细菌仍能正常存活。在自然条件下，质粒能通过接合作用将某些遗传性状传递给另一细菌，因而与细菌的遗传、变异有关，是基因工程技术的重要工具。

2．核糖体（ribosome)核糖体是游离于细胞质中的由蛋白质和核糖核酸（RNA）所组成的颗粒状结构（10～20 nm)，每个菌体内可含有数万个核糖体，为细菌合成蛋白质的场所。原核细胞与真核细胞的核糖体结构不同，细菌核糖体较小且疏松，其沉降系数为70S，由50S和30S两个亚基组成。

3.胞质颗粒（cytoplasmic granules）细菌细胞质中含有多种颗粒，大多为储藏的营养物质，包括糖原、淀粉等多糖及脂类、磷酸盐等。胞质颗粒又称为内含物（inclusion)，内含物并不是细菌所必需或恒定的结构，不同细菌有不同的胞质颗粒，同一菌在不同环境或生长期亦可不同。当营养充足时胞质颗粒较多；当养料和能源短缺时则动用储备的营养物质，颗粒减少甚至消失。胞质颗粒主要含RNA和多偏磷酸盐，故嗜碱性强，亚甲蓝染色后呈紫色，由于颗粒的颜色与菌体不同，故称为异染颗粒（metachromatic granule)。异染颗粒常见于白喉棒状杆菌，位于菌体两端，有助于细菌的鉴别（图1-7)。

图1-7白喉棒状杆菌（奈瑟染色）

三.核质

细菌为原核生物，无核膜、核仁和有丝分裂器，染色体集中于细胞质的某一区域，称为核质（nuclear material）或拟核（nucleoid)。核质的功能与真核细胞的染色体相似，控制细菌的遗传性状，故习惯上亦称之为细菌的染色体（chromosome)。细菌的染色体与真核细胞的染色体显著不同，不仅DNA量要小得多，其序列的组织性也简单得多，而且染色体为单倍体，很少有重复序列。核质的化学组成除DNA外，还有少量的RNA和蛋白质，但不含组氨酸，也不形成核小体。