与固相萃取类似，在MSPD萃取中，吸附剂的理化性质会影响对目标化合物及样品组分的吸附与洗脱。Barkel等的研究表明，吸附剂颗粒的孔径对MSPD萃取影响不大，根据实验，通常吸附剂颗粒的孔径在60A左右就可以了。载体粒径小于20／μm会降低液体流速，增加操作时间，通常吸附剂粒径在40-100μm较为合适。从经济角度出发，这种大颗粒吸附剂的价格也相对较低。

吸附剂的化学性质对MSPI萃取效率影响很大。Kristenson等比较了键合硅胶与硅胶对水果中农药的萃取结果，发现硅胶的萃取效率比键合硅胶要差很多。给出了三种载体MSPD萃取橘子中添加农药的结果，可以看到采用硅胶时，极性大的化合物回收率几乎为零，而中等极性的化合物的回收率在10％～20％。由此可见，硅胶不适用于极性化合物的MSPD。

键合硅胶吸附剂的键合相对MSP[)也有很大的影响。键合相的碳链越长，极性越小，亲脂性越强，用于亲脂性的目标化合物分离。含有氰基、氨基的键合相极性较大，用于极性大的目标化合物萃取，大部分的MSPD方法都是采用键合硅胶作为吸附剂。由于键合硅胶的表面和微孔内有一定量的硅羟基，这些硅羟基吸收样品中的水分，起到了对样品进行干燥的作用，同时，使样品更加均匀地分散在吸附剂表面。这点在MSPD中十分重要，否则研磨后的样品装入空SPE柱或玻璃注射管后，对目标化合物的洗脱将会变成十分困难。硅羟基的另外一个作用是吸附样品中的极性干扰物，起到除杂的作用。更好地解释MSPD的过程，我们假定一个MSPD的模式。实践表明，未封尾的键合硅胶用于MSPD可以得到很好的结果。通常样品／载体比例为1：4(质量比)时，经过研磨样品可以很好地分散在吸附剂表面。但有时也要根据目标化合物的化学性质及样品基质的性质对该比例进行调整。对于弱极性化合物，可选择弱极性吸附剂，如C18或C8；而极性化合物则可选择极性吸附剂，如含氰基、氨基键合相的吸附剂。Van Poucke等的研究报告表明，减少C18吸附剂的用量会导致回收率降低。也有人尝试使用高聚物作为吸附剂，例如丙烯聚合物XAD-7 HP。

样品基质对基质固相分散萃取的影响

由于样品基质经过研磨分散在吸附剂表面，形成新的层析相。显而易见，由于不同的样品基质所含组分的种类、状态和含量都不同，所形成的新层析相的组成和状态也有所不同，而不同的层析相对相同的目标化合物的影响也不同。例如，鸡肉和橘子具有两种完全不同的样品基质，前者是动物组织，含有大量的蛋白质、脂类等成分，后者是植物果实，含有大量的纤维、水及维生素C、尼克酸、类黄酮、单萜、香豆素、类胡萝卜素、类丙醇、吖啶酮、甘油糖脂质等成分。另外，MSPD的样品是分散在柱子所有的填充部分。很明显，样品基质对MSPD萃取的影响很大。

与经典SPE不同，在MSPD中，吸附与洗脱主要不是取决于吸附剂，而是取决于分散的样品。在MSPD萃取中，吸附剂已经降为次要因素。也就是说，萃取的结果在很大程度上与MSPD所形成的新层析相的性质有关。Reimer等的实验结果证明了这一点。在Reimer等的实验中，两实验员进行相同的实验，对三文鱼中的五种磺胺类药物进行MSPD萃取，所不同的是实验员A使用的研磨棒比实验员B的要大、要重，研磨时用的力量也大。结果发现实验员A的回收率70％比实验员B的回收率(50％)要高，而且实验员A所得到的萃取物中的油脂比实验员B的要少。由此可见，研磨的力度会影响样品基质分散的程度，样品基质分散的好，回收率就高，反之，回收率就会降低。

在MSPD中，由于样品基质经过研磨后成为吸附剂的一部分，改变样品基质的状态就会改变．MSPD的结果。如果在样品中加入一些试剂，例如抗氧化剂、螯合剂、除螯合剂、酸、碱等，然后再与载体一起研磨。这势必导致目标化合物与样品基质以及吸附剂间的相互作用的改变，从而影响目标化合物的洗脱。