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细胞外源基因转导的先期准备工作

发布时间:2017-03-09 00:00 作者:中国标准物质网 阅读量:506

(一)目的基因的获取与纯化

1.目的基因的获取要克隆某一基因并将其导入培养细胞,首先需分离并制备目的基因。获取目的基因的方法可通过基因组文库或cDNA文库信息分离筛选基因,然后用人工方法合成基因,并应用PCR扩增技术获取目的基因。

2.质粒DNA的纯化在进行细胞转染时,不论用何种转染方法对质粒DNA的纯度要求都比较高。质粒DNA应当是无蛋白质、无RNA和化学试剂污染,OD260/OD280应在1.8以上。下面介绍质粒DNA纯化的具体方法。

【材料】

(1) 1xTE缓冲液:含10mmol/L Tris-HCI,lmmol/L EDTA(pH 7.4)的溶液。

(2)氯仿异戊醇混合液:两者的比例为24:1(V/V)。

(3)平衡酚:取经过重蒸的苯酚,加入等体积的Tris-HCI缓冲液(pH 8.0 ),在分液漏斗中反复振荡,并加入少量固体Tris。待酚相和水相分开后,测定酚相的pH. pH大于7.5者为合格。

【方法】

(1)取质粒DNA 5~10ug,溶于100ul三蒸水中。

(2)加等体积平衡酚振荡1分钟。室温下以10 OOOr/min离心5分钟。

(3)将上清液移至另一新Eppendorf管中,加等体积氯仿异戊醇混合液,振荡10分钟。室温下以10 OOOr/min离心5分钟。

(4)将上清液移至另一新Eppendorf管中,加入1/10体积的3 mmol/L醋酸钠(pH 5.0),再加入2.5倍体积的无水乙醇

(5)置液氮中10分钟或于-20℃静置2小时,然后4℃下,20 OOOr/min离心5分钟。

(6)倒掉上清液,再加入70%乙醇。4℃下,15OOOr/min离心10分钟。离心后将乙醇倒掉。

(7)将Eppendorf管置超净台上吹干。然后,溶于1xTE缓冲液,备用。

3.目的基因与载体的连接利用DNA连接酶将目的基因片段和载体DNA连接在一起,成为一个新的重组分子,这就是DNA的体外连接。目的DNA片段被限制性内切酶消化后,其末端只可能有三种形式:①带有相同黏性末端;②带有非互补的黏端;③带有平末端。与载体DNA可出现不同的连接后果。

【材料】

(1)试剂:0.5mol/L EDTA、乙醇、TE (1Ommol/L Tris-HCI, pH 8.0, 1mmol/L EDTA,pH 8.0)、线性目的基因,T4连接酶与配套缓冲液。已经酶切处理过的线性化载体、10x小牛肠碱性磷酸酶(calf intestinal alkaline phosphatase,CIP),lOxCIP缓冲液;

(2)器材:移液器、移液器头(Tip头),Eppendof管、水浴箱等。

【方法】

(1)黏性末端连接:为防止载体DNA自身环化,在连接前需除去载体分子5’端磷酸,使之最大程度地抑制载体环化现象。

1)建立下列去磷酸基团的反应系统:线性化载体10ul, CIP 0.5ul,10×CIP缓冲液2ul,双蒸水7.5ul, 37℃水浴15分钟。再加入CIP 0.5 ul,置55℃水浴45分钟。加入2 ul 0.5mmol/L EDTA,于65℃灭活15分钟。乙醇沉淀,TE溶解。

2)建立连接体系:在0.5m1 Eppendof管中加入线性化目的基因(0.4ug)4u1,载体DNA(经CIP处理后)1ul,1OXCIP缓冲液1 u1,T4 连接酶1 ul,加双蒸水至10u1。置16℃水浴12~16分钟。

(2)平黏端连接

1)制备目的基因DNA酶切片段(如两端均为EcoR I端);

2)制备载体DNA酶切片段(如一端为EcoR I 黏端,一端为其他酶切的黏端);

3)用T4连接酶连接匹配的黏性末端(线性化目的基因与载体DNA中间,用T4 DNA连接酶加以连接),另一端不匹配无法连接。

4)用Klenow补平不匹配的黏末端:目的基因和线性载体DNAO.5ul,l0x大肠埃希菌DNA聚合酶I的Klenow片段1 u1, 2mmol/L dNTP 2u1,加双蒸水至20 u1。置37℃水浴1分钟。

5)乙醇沉淀,溶于7ul TE液中,取5ul TE,加1 ul连接缓冲液,1ul连接酶,双蒸水13 ul,作用16~20分钟。

6)电泳后观察:取2ul TE反应液,经电泳后与连接前的TE作对照,观察连接效果,并估计含量。取适量进行细胞内基因转化实验。

(二)待转染细胞的准备

常用的待转染细胞主要是已建立的细胞系,如HeLa,CHO,CV-1,HK细胞等。根据研究的需要也可用原代细胞。细胞的培养过程以及培养基的配制、培养的具体条件等与一般细胞的培养操作完全相同。但是,基因转染对细胞的生长状态和密度有特定的要求,在实验中要加以注意,通过预试确定待转染细胞最佳生长状态和密度。例如,根据经验,在用Ca2+转染时,以处于旺盛分裂期、相互之间留有少量空隙的细胞转染率为最高。原因为:①沉淀在细胞表面的DNA-Ca3 (P03)2复合物对细胞有一定毒性作用,分裂旺盛的细胞对这种毒性作用抵抗能力强;②分裂旺盛的细胞对DNA一复合物吞噬能力比老化的细胞强;③转染后的细胞迅速恢复分裂能力,留有少量空隙的目的是给转染后的分裂细胞保留适当的空间,使细胞有良好的生长环境。下面就待转染细胞的准备作一简述。

【材料】

1.培养器皿的准备细胞培养所用的培养瓶皿、血清瓶、吸管、离心管等均须经去污剂清洗、烘干后于清洁酸液内浸泡过夜,取出后在清水中漂洗干净,以66.7 kPa高压灭菌20分钟后备用。处理的详细过程可见第二章第二节,清洗的玻璃器皿要求干净、透明、无油迹。

2.培养基的配制多数实验室采用RPMl 1640和DMEM培养液。配制的培养基用5.6% NaHC03溶液调pH至7.0~7.2,然后加入10%小牛血清和青霉素50~l00IU/ml,链霉素50~100 ug/ml。最后用0.22 um的微孔滤膜过滤除菌。分装于l00ml血清瓶,于4℃保存备用。

【方法】

1.贴壁细胞的传代

(1)待细胞生长接近铺满培养瓶壁时,倒掉培养液。

(2)在培养瓶中加入0.25%胰蛋白酶溶液,消化1~5分钟(要注意每种细胞适用的消化酶的种类、浓度和消化时间不同,必要时应当用预实验加以确定)。然后用吸管吹打使细胞分散。

(3)收集细胞悬液,于台式离心机上以1500r/min离心5分钟,沉淀细胞,倒掉消化液。

(4)将细胞沉淀转入新的培养瓶中,并加入新鲜培养液。然后按1:2或1:3分瓶培养。

2.悬浮细胞的传代

(1)待细胞生长接近满培养瓶时,收集细胞悬液,于台式离心机上以1500r/min离心5分钟,沉淀细胞,倒掉消化液。

(2)将细胞沉淀转入新的培养瓶中,并加入新鲜培养液。然后按1:2或1:3分瓶培养。

挑选边缘整齐、无折光颗粒,处于对数生长期的细胞作转染。

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