以淀粉胶、琼脂或琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶等作为支持介质的区带电泳法称为凝胶电泳。其中聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis，PAGE)普遍用于分离蛋白质及较小分子的核酸。琼脂糖凝胶孔径较大，对一般蛋白质不起分子筛作用，但适用于分离同工酶及其亚型，大分子核酸等。

琼脂糖是由琼脂分离制备的链状多糖。其结构单元是D一半乳糖和3，6一脱水一L一半乳糖。许多琼脂糖链依氢键及其它力的作用使其互相盘绕形成绳状琼脂糖束，构成大网孔型凝胶。因此该凝胶适合于免疫复合物、核酸与核蛋白的分离、鉴定及纯化。

琼脂糖凝胶电泳分为垂直及水平型两种。其中水平型可制备低浓度琼脂糖凝胶，而且制胶与加样都比较方便，故应用比较广泛。

(1)设备与试剂

①仪器装置电泳室及直流电源同纸电泳。

②试剂核酸分离一般用连续缓冲体系，常用的有TBE(O.08moL／L Tris.HCl，pH8.5，O.08mol／L硼酸，0.0024mol/L EDTA)和THE(0.04mol／L Tris·HCl,pH7.8，O.2mol／L醋酸钠，O.0018mol／LEDIlA)。

醋酸一锂盐缓冲液(pH3.O) 取冰醋酸50ml，加水800ml混合后，用氢氧化锂调节pH值至3.0，再加水至1000ml。

甲苯胺蓝溶液 取甲苯胺蓝0.1g，加水100ml使溶解。

(2)操作法

①凝胶制备取琼脂糖约O．2g，加水10ml，置水浴中加热使溶胀完全，加温热的醋酸一锂盐缓冲液(pH3．0)10ml，混匀，趁热将胶液涂布于大小适宜(2.5cm×7.5cm或4cm×9cm)的玻板上，厚度约3mm，静置，待凝胶结成无气泡的均匀薄层，即得。

②对照品溶液及供试品溶液的制备照各品种项下规定配制。

③点样与电泳在电泳槽内加入醋酸一锂盐缓冲液(pH3．0)，将凝胶板置于电泳槽架上，经滤纸桥浸入缓冲液。于凝胶板负极端分别点样1μl，立即接通电源，在电压梯度约30V／cm、电流强度1—2mA／cm的条件下，电泳约20min，关闭电源。

④染色与脱色 取下凝胶板，用甲苯胺蓝溶液染色，用水洗去多余的染色液至背景无色为止。