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(1)引物/探针 引物/探针序列见表11—3,用TE缓冲液(pH 8.0)或重蒸水分别将表l1-3引物/探针稀释到10μmol/L。
(2)PCR检测
①对照设置 阴性对照以非转基因水稻DNA为模板;设置两个阳性对照,分别用转Bt基因抗虫水稻材料中提取的DNA,以及转Bt基因水稻含量为0.1%的水稻DNA作为PCR反应体系的模板;空白对照以重蒸馏水代替DNA模板。
②PCR反应体系 按表11—4配制PCR扩增反应体系,也可采用等效的实时荧光PCR反应试剂盒配制反应体系,每个试样和对照设3次重复。
③PCR反应 PCR反应按以下程序运行。
第一阶段95℃/10min;第二阶段95℃/15s、60℃/60s,循环数40;在第二阶段的退火延伸时段收集荧光值,PCR反应结束后,根据收集的荧光曲线和Ct值判定结果。
(3)结果分析 阈值设定:实时荧光PCR反应结束后,设置荧光信号阈值,阈值设定原则根据仪器噪声情况进行调整,以阈值线刚好超过正常阴性样品扩增曲线的最高点为准。
质量控制:在内源参照基因SPS和GOS基因扩增时,空白荧光曲线平直,阴性对照和阳性对照出现典型的扩增曲线,或空白对照荧光值低于阴性对照和阳性对照荧光值的15%;在外源基因(序列)国MV35S、NOS和Bt扩增时,空白对照和阴性对照的荧光曲线平直,阳性对照出现典型的扩增曲线,或空白对照和阴性对照的荧光值低于阳性对照荧光值的15%,表明反应体系工作正常。否则,表明PCR反应体系不正常,需要查找原因重新检测。
结果判定:在PCR反应体系正常工作的前提下,待测样品基因(序列)检测Ct值大于或等于40,则判定样品未检出该基因(序列);待测样品基因(序列)出现典型的扩增曲线,且检测Ct值小于或等于阳性对照的Ct值,则判定样品检出该基因(序列):待测样品,基因(序列)出现典型的扩增曲线,检测Ct值大于阳性对照的Ct值但小于40,应进行重复实验,如重复实验的外源基因(序列)出现典型的扩增曲线,且检测Ct值小于40,则判定样品检出该基因(序列)。
结果表述
①在试样的PCR反应中,未检出SPS基因和/或GOS基因.结果表述为“样品中未检出水稻成分”。
②在试样PCR反应中,检出Bt基因,对于水稻及以水稻为唯一乐辩的产品。结果表述为“样品中检出转Bt基因水稻成分”;对于混合原料产品.结果表述为。样品中检出西基因”,需要进一步对加工原料进行检测确认。
③在试样PCR反应中,未检出Bt基因,但检CaMV35S启动子和.。或NOS终止子,表明该样品含有转基因成分,结果表述为“样品中检出CaMV35S启动子和/或NOS终止子,未检出转Bt基因水稻成分”。④在试样PCR反应中,检出水稻内标准基因,但未检出Bt基因、CaMV 35S启动子和NOS终止子,结果表述为“样品中未检出转Bt基因水稻成分”。
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