(1) 焦磷酸二乙酯(DEPC)：是一种强烈，但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸残基的咪噢环结合使蛋白质变性，从而抑制酶的活性。

(2）异硫氰酸胍：目前被认为是最有效的RNA酶抑制剂，它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。它既可破坏细胞结构，使核酸从核蛋白中解离出来，又对RNA酶有强烈的变性作用。

(3）氧钒核糖核苷复合物：由氧化钒离子和核苷形成的复合物，它和RNA酶结合形成过渡态类物质，几乎能完全抑制RNA酶的活性。

(4) RNA酶的蛋白抑制剂（Rnasin )：从大鼠肝或人胎盘中提取得到的酸性糖蛋白。Rnasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂，可以和多种RNA酶结合，使其失活。

(5）其他：SDS、尿素、硅藻土等对RNA酶也有一定抑制作用。