一、细菌染色体

细菌染色体（bacterial chromosome）为一条环状双链DNA分子，呈超螺旋结构，其反复折叠卷曲聚集在一起形成较为致密的区域，又称拟核（nucleoid)。细菌染色体相对较小(4.6×10⁶ bp，约4000个基因），细菌的基因结构呈连续性，无内含子，因此，转录后的RNA不需加工剪切即可产生成熟的mRNA。

二、质粒

质粒(plasmid)是细菌染色体外的遗传物质，为环状双股超螺旋DNA，分子质量在1～1000 kb。在疏螺旋体属、链霉菌属和酵母菌巾发现有少数质粒呈线状。

1．质粒的基本特性

(1)自主复制：质粒DNA的复制往往不依赖细菌染色体而自主复制，称为松弛型质粒(relaxed plasmid)。仅有少数质粒可与染色体同步复制，称为紧密型质粒( stringent plasmid)。

(2）编码某些特定性状：质粒DNA可编码某些特殊功能的蛋白质，从而赋予宿主菌某些特定的生物学特性，如耐药性等。

(3)可转移性：质粒可在细菌间转移。通过接合作用能在细菌间转移的质粒，称为接合性质粒，如F质粒。

(4)相容性与不相容性：两种结构相似的质粒不能稳定地存在于同一个细菌细胞内，即两者不相容。反之，两种结构不同的质粒能稳定地存在于同一个细菌细胞内，即两者相容。

(5)质粒的丢失与消除：质粒不是细菌必备的结构，可以自行丢失或经人工处理而消除。失去质粒的细菌，其生命活动可不受影响。

2．常见质粒

(1)致育因子（fertility plasrnid,F质粒)。F质粒能编码性菌毛，性菌毛可介导细菌间接合作用的发生。

(2)耐药性质粒（resistance plasmid)：耐药性质粒有接合性耐药质粒和非接合性耐药质粒两种。前者可通过细菌间的接合作用进行转移；后者不能通过接合作用进行转移。接合性耐药质粒又称R质粒，由耐药传递因子和耐药决定因子（r因子）两部分组成。前者编码宿主菌产生接合及自主复制的蛋白质，具有传递基因的功能；后者决定对药物的耐受性。通过耐药质粒的转移，耐药菌可将耐药基因转移到敏感菌中，使后者也成为耐药菌。

(3）大肠埃希菌毒素质粒（colicinogenic plasmid, Col质粒）：Col质粒编码大肠埃希菌的大肠菌素。

(4)毒力质粒（(virulent plasmid, Vi质粒）：毒力质粒编码与细菌致病性有关的蛋白质。如致病性大肠埃希菌产生的耐热性肠毒素是由ST质粒决定的，产生不耐热肠毒素是由LT质粒决定的。

三、转座因子

转座因子（transposable element）是细菌基因组中能改变自身位置的一段特殊的核苷酸序列，其位置的改变可发生在染色体的不同位点，也可发生在染色体和质粒之间。美国遗传学家Mc Clintock早在1951年就在玉米中发现了第一个转座因子，直到1968年Shapir。才在E.coli中发现了转座因子，从而引起人们的重视。转座因子DNA片段的两端有反向或同向的重复顺序，中间部分有结构基因，如与转座有关的转座酶基因，该基因编码的转座酶使它们整合到受体DNA上的某一位点，此位点为一段寡核苷酸的同向重复顺序。转座因子的转座行为可导致DNA序列的重排、基因突变，在细菌变异及进化上具有重要意义。

转座因子按结构和功能的不同分为两类。

1．插入序列（insertion sequence,IS)插入序列的两末端为反向重复序列，中间为转座酶基因，是最小的转座因子。

2．转座子（transposon,Tn)转座子除具有插入序列外，在其中间还携带有很多结构基因，如耐药基因、毒力基因等，这些基因可随Tn的转座而在染色体及质粒之间移动，对于细菌的耐药性及毒力的播散发挥着重要作用。