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用细胞提取物作为酶进行甲基化试验

发布时间:2015-09-22 00:00 作者:中国标准物质网 阅读量:968

把小鼠表达转甲基酶蛋白的基因敲除掉,做成细胞系ES或MEF细胞,这些细胞就没有特异的酶反应。这些细胞反应物让我们快速知道,我们感兴趣的底物在甲基化反应中是不是必需,以及反应的特异性如何。这将用到GST融合蛋白技术。这些底物被固定到琼脂糖珠子上,体外的甲基化试验就用细胞裂解液作为酶,使氖标记的甲基从AdoMet转移到GST融合蛋白上。这里我们用的底物是PABP1 (PRMT4的底物)和NP13 (PRMT1/HMT1的底物)。Prmt4+/+和Prmt4-/-MEF的细胞系作为酶的来源。

(1) 按照3.1中讲述的方法纯化底物,在第12步停下来,不用洗脱液洗珠子。

(2)用预冷的PBS洗包被在珠子上的底物。

(3) 将珠子用SDS-PAGE,考马斯亮蓝染色定量,分别上1 μg、2 μg和10μg的BSA作为参照。

(4) 将对数生长期的MEFs接种到10cm的培养平皿里,至密度达80%。

(5)用预冷的 PBS洗一次。

(6)加500 μ1预冷的PBS。

(7)用塑料细胞刮子把细胞从培养皿上刮下。

(8)把液体收到1. 5m1 epyendoof管里。

(9)超声l0s破碎细胞,超0.5s间隔0. 5s。

(10) 4℃10000g离心l0min。

(11)将上清移入一个干净的1. 5 ml epyendoof管中(300μl),再加入1 μg步骤3中的琼脂糖珠子(大约20μl)。

(12)加入3 μl S-腺苷L-[甲基-3H]甲硫氨酸。

(13) 30℃颠倒混匀2h。

(14)用预冷的PBS洗琼脂糖珠子3次。

(15)加入30μl×蛋白上样缓冲液,95℃加热5 min。

(16)将甲基化的底物进行SDS - PAGE,用Tris-甘氨酸缓冲液100V电泳l h。

(17)用半干转印法,将分离的样品转印到PVDF膜上。

(18)将EN 3HANCE喷在固定有蛋白的PVDF膜上3次,每次操作间隔l0min。

(19)将PVDF膜晾30分钟至完全晾干,放置在X胶片上过夜。

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