根据药物在体内分子水平上的作用方式，是否基本上依靠特异性化学结构的存在和排列，可把药物分成两种类型，即结构特异性药物和结构非特异性药物。

结构非特异性药物的生物活性（药理作用）主要受药物理化性质的影响，与化学结构类型关系较少，当结构有所改变时，对生物活性无明显影响。如全身麻醉药，从化学结构上看，有气体、有低分子量的烃、卤烃、醇和醚等，其作用主要受药物的脂水（气）分配系数的影响。

大多数药物属于结构特异性药物，其生物活性与化学结构密切相关，其作用与体内特定受体的相互作用有关，药物的化学结构稍加改变，药物分子与受体的相互作用和相互匹配就会发生变化，导致药效学性质发生变化。