药物在代谢过程中，经过水解、氧化和还原反应等生物转化后的药物分子，如果不能排出体外，还会有一些内源性化合物（由糖、脂质或蛋白质衍生的结合剂）与之结合，经结合后的代谢物多失去活性，且水溶性增大，易从尿或胆汁中排出体外，这一过程称为结合反应。

内源性化合物主要是指葡萄糖醛酸、硫酸、氨基酸、谷胱甘肽、巯基尿酸等。常见的结合代谢反应类型如下。

与葡萄糖醛酸结合最常见的反应。具有羟基、羧基、氨基和巯基等官能团的药物与体内的葡萄糖醛酸结合形成葡萄糖苷酸而排出体外与硫酸结合具有羟基（酚羟基、醇羟基、N-羟基等）和氨基（芳香胺等）的药物及代谢物，在磺基转移酶的催化下，结合成硫酸酯和氨基磺酸酯而排出体外与氨基酸结合芳基烷酸、芳基羧酸和杂环羧酸的代谢，常以汝基与氨基酸的氨基，在辅酶A(CoA）的参与下，缩合成酰胺而失去活性与谷胱甘肽结合谷胱甘肽含巯基、氨基，是强亲核基团，与亲电性代谢物如环氧化物、N-氧化物、羟胺、酰卤等结合，有去毒灭活作用，结合物水溶性增加乙酰化结合含有氨基、磺酰胺、肼基及酰肼基团的药物，在体内酰基转移酶的催化下进行，以乙酰辅酶A作辅酶，进行乙酰化反应，大都生成无活性或活性较小的产物，因而是一条有效的解毒途径。