细胞收藏机构如ATCC、国家实验细胞资源共享平台的协和细胞资源中心等对所用的血清、培养基及冻存的细胞均进行细菌、真菌及支原体检测。用血平板、各种不同的肉汤培养基进行细菌和真菌的培养。用培养法、荧光染色法及PCR法等检测支原体。

如何判断自己所培养的细胞是否有其他细胞交叉污染？如何避免交叉污染？如果两种形态差别较大的细胞发生交叉污染，仔细的形态观察就能确定。通常这种方法太差。某些表明标记的免疫荧光染色、同工酶检钡组、细胞遗传学检查及DNA分析可检测种属间或种属内的交叉污染。最好的防止交叉污染的措施就是：每次只操作一种细胞，认真仔细做好标记。