离子色谱仪器一般由淋洗液输送系统、进样系统、分离系统、抑制或衍生系统、检测系统及数据处理系统等几部分组成，其结构与常规的高效液相色谱极为相似，但离子色谱与常规高效液相色谱相比最明显的差异在于：①离子色谱由于其淋洗液采用酸或碱，流路一般采用PEEK材料；②离子色谱在其检测器之前一般带有抑制器。