运用有两种小分子可以抑制转甲基酶的作用：

①一种是与其结构相似的化合物，因此竞争性的抑制转甲基酶的作用；

②抑制核苷水解酶，使细胞内AdoHey水解酶大量富集，最终反馈性的抑制甲基化反应。

Sinefun-gin是一种常用的AdoMet类似物，腺苷二醛(AdOx）是常用的AdoHey水解酶抑制剂。因为细胞内去甲基化水平非常低或者根本不存在，所以内源的蛋白质底物是完全以甲基化方式存在的。细胞用AdOx处理后，产生低甲基化的蛋白裂解物，这样就在体外作为转甲基酶的底物。这里我们应用AdOx体内的甲基化实验，来确定用氖来标记是由于AdoMet依赖的转甲基酶对甲基的调节作用。

(1) AdOx处理细胞，以及体内的甲基化反应用二甲基亚砜配制AdOx的储液（0. 5mol/L)。将HeLa细胞接种到l0cm培养皿内至密度达60%。将细胞用终浓度为20 μmol的AdOx处理，24h后，这些细胞就在体内被甲基标记了。这个过程与上面步骤3.3中相似，但不用A液、B液，而应用AdOx。

(2）用a-Sam68抗体进行免疫沉淀反应RNA结合蛋白Sam68是PRMTI的底物，在甲基化实验中常被用作阳性对照。免疫沉淀反应用a-Sam68抗体，内源的Sam68先用SDS-PAGE分离，再转到PVDF膜上，之后用X线间接摄影法观察结果（具体步骤见3.3中的第20,21步）。看过后，同一张膜用TBST洗，用a-Sam68抗体做Westernblotting，确保上样量一致。