药物的脂溶性和水溶性可以用脂水分配系数P表示：

P=Co/Cw

式中，P是药物分配达到平衡时在有机相中的浓度（Co）和水相中的浓度（(Cw)之比。

P值可以表示药物脂溶性的大小，P值越大，脂溶性越高，由于P的数值较大，常用其对数1gp表示。

药物在转运扩散至血液或体液时，需要有一定的水溶性（又称亲水性）。而通过脂质的生物膜，又需要有一定的脂溶性（又称亲脂性）。各类药物因其作用不同，对水溶性和脂溶性有不同的要求，如作用于中枢神经系统的药物，需通过血一脑脊液屏障，因此需要有较高的脂溶性。脂水分配系数过大或过小都可能影响药物的吸收。

药物化学结构的改变对药物脂水分配系数影响显著。当药物分子中引入烷基、卤素原子、芳环、酯基等时，可以增加药物的脂溶性。反之，如引入亲水性的-COOH、-OH、-NH2等极性基团时，则会增加水溶性。