评价时段内，断面（测点）、河段、湖库、水系水质为“优”和“良好”时，或者属于“贫营养”、“中营养”和“轻富营养”时，不评价主要污染指标。

1．主要污染指标的筛选方法

将断面（测点）水质超过Ⅲ类标准的指标按其超标倍数大小排列，取超标倍数最大的前三项为主要污染指标（溶解氧不考虑）。

确定了主要污染指标的同时，应在指标后标注该指标浓度最大值超过Ⅲ类水质标准的倍数，即最大超标倍数，如COD_MN(1.2)。对于水温、pH和溶解氧等指标不计算最大超标倍数，其污染程度视污染源排放特征而定。

河流、湖库、水系主要污染指标的确定方法：将水质超过班类标准的指标按其断面超标率大小排列，取断面超标率最大的前三项为主要污染指标。

对于断面（测点）数少于5个的河流、水系，分别说明每个断面（测点）的主要污染指标。

2．湖泊水库主要污染指标确定

如果湖泊、水库水质污染指数大于60，并且富营养化水污染指数小于60，则表明水体污染以化学污染为主，筛选主要污染指标。

如果湖泊、水库水质污染指数大于60，并且富营养化水污染指数大于60，则表明水体污染的化学污染和富营养化问题同时存在，主要筛选化学污染指标，同时氮、磷也为主要污染指标。

如果湖泊、水库水质污染指数小于60，并且富营养化水污染指数大于60，则表明水体污染以富营养化为主，且氮、磷为主要污染指标。