离子交换色谱法(ion exchange chromatography，IEC)通过固定相表面带电荷的基团与试样组分离子和流动相离子进行交换、离子一偶极作用或吸附实现色谱分离，主要用于离子型化合物的分离。

离子交换色谱是建立在离子交换分离理论和技术基础上的。在阴离子交换色谱中，试样阴离子X与流动相离子Y一争夺离子交换剂(即离子交换固定相)上带电荷的基离子交换色谱的固定相又称为离子交换剂。根据其基体的不同可以分为树脂型、全多硅胶型和表面多孔硅胶型等。

离子交换色谱法的流动相大多为水溶液，通过调节流动相的pH值和离子强度就可调整溶质组分的保留值，通常可使用含有一定盐离子浓度的缓冲溶液达到目的。当流动相的离子强度大时，加入的盐使离子浓度增加，削弱了溶质组分离子的竞争吸附能力，使溶质组分的保留值降低。流动相的pH值的变化能导致可解离化合物在溶液中电离度发生变化，如电离度变大，则组分的保留值也增大。一般来说，离子强度的变化要大于pH值变化对保留值的影响。

如在流动相中添加有机溶剂，可使峰的拖尾现象得到改善，调节溶质组分保留值。如果是加入极性化合物如醇类，就将抑制离子交换作用，分离机制将转化为分配形式，即在离子交换剂所吸附的水相和流动相之间分配。常用的有机溶剂有甲醇、乙醇、乙腈、二氧六环等。

离子交换色谱法的缺点是离子交换剂的品种少，性能也因不同批号而异，柱效低，稳定性也差。